Comme je l'ai fait remarqué dans ta présentation, on a le même matériel, donc ça ne devrait pas être trop compliqué de se comprendre.
Les Seymour Duncan vont effectivement bien sur ce genre de guitare, quoi que les Dimarzio sont aussi excellents, peut-être même un peu plus dans l'esprit des RG en tilleuil / érable (là où les SD rendent vraiment bien sur une Les Paul tout acajou par exemple).
Le SH-4 est un bon micro chevalet, à l'aise dans tous les domaines, parfait pour le Rock, Hard Rock, Heavy... Son homologue en manche est le plus souvent le SH-1. Cette association est très répandue et a largement fait ses preuves ! Chez Dimarzio, le «duo gagnant» qu'on retrouve couramment sur les RG upgradées, c'est Air Norton / Tone Zone. Le genre de micros qui réveillent ces guitares sommes toutes impersonnelles que sont les RG de base, tout en gardant un grain typique.
Pour ce qui est du micro milieu, c'est à toi de voir... Si tu en as une utilisation intensive, tu peux le changer pour un SD ou un Dimarzio sans forcément chercher bien loin (je n'ai pas de modèle précis en tête). Mais si tu t'en sers finalement peu, ou juste pour splitter les Humbuckers en position intermédiaire, le Infinity 3 de base ne sera pas trop un problème et devrait amplement suffire.
MAIS, je dois te prévenir. Le Vypyr est un ampli à modélisation, et un changement de micro sur ta guitare ne sera pas ou peu audible ! Imagine toi que ce qui est à l'intérieur de ton ampli, c'est un processeur qui triture le signal de ta guitare pour le faire sonner comme tu lui demandes, peu importe le signal originel... j'ai déjà branché plusieurs gratte dans mon Vypyr, et la différence est vraiment minime si ce n'est inexistante, pour des guitares pas franchement pareilles, loin s'en faut !
Donc réfléchi bien... Je sais que ces petites grattes sont confortables et qu'on a vite fait d'avoir envie de les upgrader (ça fait bien longtemps que j'avais envie de le faire), surtout que le jeu en vaut la chandelle. Sauf qu'une fois branchée dans un Vypyr, c'est pour ainsi dire inutile, et c'est s'être donné bien du mal et bien des sous pour un résultat vain...
En espérant que ça t'aidera dans ton choix
Edit : Un petit lien vers le topic similaire que j'avais crée pour ma RG, on m'avait bien conseillé à l'époque et tu devrais y trouver beaucoup de réponses
changement-de-micros-ibanez-rg-t34787.h ... banez%20RG
). Je joue beaucoup de styles différents, par exemple the offspring, nickelback, "nothing else matters" de Metallica, ou encore Linkin Park. Il me faut des micros assez polyvalents, pour aller avec mon Peavey Vypyr 15W. Donc en chevalet j'avais repéré le SH-4, qui apparemment est excellent, qu'en pensez-vous ? Aussi pour le micro en manche et le single coil, je ne m'y connai pas du tout. Vous en auriez à me conseiller ? Je veux absolument des Duncan, car j'en ai déja testé et ils sont vraiment super. 
